Media Tanam Hidroponik merupakan komponen krusial dalam sistem pertanian tanpa tanah ini, berfungsi sebagai penopang fisik bagi akar tanaman. Berbeda dengan tanah yang menyediakan nutrisi, media tanam hidroponik dirancang untuk bersifat inert atau minim nutrisi, sehingga tanaman dapat sepenuhnya bergantung pada larutan nutrisi yang diberikan. Pemilihan media yang tepat sangat memengaruhi keberhasilan pertumbuhan tanaman.
Rockwool adalah salah satu Media Tanam Hidroponik yang paling populer dan serbaguna. Terbuat dari batuan vulkanik yang dipanaskan hingga meleleh dan dipintal menjadi serat, rockwool memiliki struktur berpori yang sangat baik dalam menahan air sekaligus menyediakan aerasi yang cukup untuk akar. Ideal untuk penyemaian hingga pertumbuhan dewasa, rockwool sering digunakan di berbagai skala budidaya.
Hydroton atau leca (lightweight expanded clay aggregate) adalah pilihan lain yang banyak diminati. Berbentuk bola-bola tanah liat yang dibakar, hydroton ringan, berpori, dan dapat digunakan berulang kali setelah dibersihkan. Kelebihannya adalah stabilitas fisik yang baik dan tidak mudah membusuk. Hydroton sangat cocok untuk sistem hidroponik deep water culture atau ebb and flow.
Cocopeat, atau serabut kelapa, merupakan Media Tanam Hidroponik organik yang ramah lingkungan. Diperoleh dari sabut kelapa yang telah diolah, cocopeat memiliki kapasitas menahan air yang tinggi dan aerasi yang baik. Sebelum digunakan, cocopeat perlu dibilas untuk menghilangkan kadar garam yang tinggi. Cocopeat sangat baik untuk menopang tanaman dengan sistem drip irrigation.
Perlite dan vermikulit sering digunakan sebagai campuran Media Tanam atau sebagai media tunggal. Perlite adalah batuan vulkanik yang dipanaskan hingga mengembang, ringan, dan memiliki aerasi sangat baik. Vermikulit adalah mineral yang dipanaskan, dengan kemampuan menahan air yang luar biasa. Kombinasi keduanya dapat menciptakan media yang seimbang untuk pertumbuhan akar.
Kerikil dan pasir juga dapat digunakan sebagai Media Tanam Hidroponik dasar, meskipun kurang ideal dibandingkan pilihan lain. Keuntungannya adalah ketersediaan dan biaya yang rendah. Namun, keduanya kurang mampu menahan air dan nutrisi, serta memiliki aerasi yang terbatas. Penggunaannya seringkali memerlukan frekuensi penyiraman nutrisi yang lebih tinggi.